פיגמנטים אורגניים הם חומר אורגני בלתי מסיס, המוסף בדרך כלל למצע במצב מפוזר מאוד כדי לצבוע את המצע. ההבדל המהותי בינם לבין צבעים הוא שניתן להמיס צבעים במצע הצביעה בו נעשה שימוש, בעוד שפיגמנטים אינם מסיסים בתווך שבו הם משמשים וגם לא במצע שיש לצבוע.
פיגמנטים וצבעים רבים עקביים במבנה הכימי, ושיטות שימוש שונות יכולות לגרום להם להמיר זה את זה. לדוגמה, כמה צבעי בור וצבעי בור מגודרים יכולים לשמש כצבעי סיבים אם הם מופחתים לגופי לוקו; אם הם לא מופחתים, הם יכולים לשמש כפיגמנטים לדיו בדרגה גבוהה.
פיגמנטים אורגניים נמצאים בשימוש נרחב בדיו, צבעים, ציפויים, צביעת עיסת גולמית של סיבים סינתטיים, כמו גם הדפסת ציפוי בד, פלסטיק, גומי וצביעת עור, ביניהם הכמות הגדולה ביותר של פיגמנטים משמשת בדיו. תפוקת הפיגמנטים האורגניים מהווה כרבע מסך התפוקה של הצבעים.
ישנם שני סוגים של צבעים העשויים מתרכובות אורגניות: טבעיים ומלאכותיים, כמו אינדיגו וכחול Haichang. מקבילים להם צבעים אנאורגניים, כמו צבעים מינרליים.
צבעים אורגניים טבעיים טהורים הם בעיקר צבעי צמחים. לפי ההרכב הכימי ניתן לחלקו לשבעה סוגים: קרוטנואידים, אנתרקינונים, נפתוקינונים, פלבנואידים, כורכומין, אינדיגו וכלורופיל.
